Jungtinė doktorantūra su Vilniaus Gedimino technikos ir Kauno technologijos universitetų (koordinuojanti institucija – Kauno technologijos universitetas).
Informatikos inžinerijos mokslo šaka orientuota į skaičiavimo, informacijos apdorojimo, informacinių sistemų saugos, programų inžinerijos problemų sprendimą taikant mokslines žinias ir naujausias technologijas. Ši doktorantūros programa ruošia lyderius, kurie kuria ir formuoja informatikos inžinerijos mokslo šakos ateitį.
Mokslinių tyrimų kryptys: 1. Dirbtinio intelekto ir sprendimų priėmimo sistemos; 2. Informacijos ir informacinių technologijų sauga; 3. Informacinės technologijos, ontologinės ir telematikos sistemos.