Aeronautikos inžinerijos katedra įkurta 2017 m. sujungus Aviacijos prietaisų katedrą ir Aviacinės mechanikos katedras. Aeronautikos inžinerijos katedros vedėjas yra doc. dr. Eduardas Lasauskas. Aviacijos prietaisų katedra įkurta 1997 m., reorganizavus skrydžių valdymo katedrą. Aviacijos prietaisų katedrai vadovavo doc. dr. Algimantas Jakučionis (1997 – 2015) ir doc. dr. Darius Miniotas (2015 – 2017). Aviacinės mechanikos katedra įkurta 1993 m. VILNIUS TECH Mechanikos fakultete. Tada ji vadinosi Aviainžinerijos katedra. 1994 m. ji perduota Aviacijos institutui ir pervadinta į Aviacinės mechanikos katedrą. Šiai katedra vadovavo doc. dr. Juozas Zujus (1993 – 1999), prof. habil. dr. Eugenijus Pileckas (1999 – 2001), doc. dr. Eduardas Lasauskas (2001 – 2022). Šiuo metu katedrai vadovauja doc. dr. Darius Rudinskas.
Aeronautikos inžinerijos katedra yra profilinė, rengianti avionikos bakalaurus, aviacijos mechanikos bakalaurus ir aeronautikos inžinerijos magistrus.
Šiuo metu katedroje dirba 2 profesoriai-partneriai, 5 docentai, 16 lektorių, 7 asistentai.