Fundamentinių mokslų fakultetas Padaliniai Chemijos ir bioinžinerijos katedra Studijos

Chemijos ir bioinžinerijos katedra

Turite klausimų?

susisiekite jums patogiu būdu

Telefonas (0 5) 274 4839

El. paštas crypt:PGEgaHJlZj0ibWFpbHRvOmNoZW1rYXRAdmlsbml1c3RlY2gubHQiPmNoZW1rYXRAdmlsbml1c3RlY2gubHQ8L2E+:xx

Studijos

Anotacijos

Studento vardas, pavardė	Baigiamojo darbo pavadinimas	Baigiamojo darbo vadovas
2025 metų bakalauro baigiamųjų darbų anotacijos
Studento vardas, pavardė Kornelija Rubežiūtė	Baigiamojo darbo pavadinimas Modifikuotų pirimidino darinių cheminė sintezė ir jų biologinio skaidymo tyrimai	Baigiamojo darbo vadovas dr. Daiva Tauraitė
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamojo bakalauro darbo metu buvo chemiškai sintetinamos modifikuotos pirimidino heterociklinės bazės bei tiriamas biologinis jų skaidymas. Medžiagos sintetinamos remiantis literatūra arba ankščiau atliktais bandymais, o jų grynumas nustatomas BMR, HPLC bei UV/Vis analizės metodais. Iš viso susintetinti septyni junginiai, kurie turi modifikacijas 2-oje ir/arba 4-oje padėtyse. Taip pat šiame darbe atliktas ir gautų junginių biologinis skaidymas su uracilo auksotrofinėmis E. coli ?pyrF bakterijomis. Šio bandymo metu nustatyta, kad šios bakterijos geba skaidyti tik 2,4-dichlorpirimidiną ir 4-chlor-2-metiltiopirimidiną iki nemodifikuoto uracilo. Darbą sudaro šešios dalys: įvadas, literatūrinė dalis, metodinė dalis, tyrimo rezultatai bei jų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas, priedai. Darbo apimtis: 38 psl. be priedų, 11 iliustr., 4 lent., 32 bibliografinis šaltinis. Atskirai pridedami darbo priedai. Raktiniai žodžiai: biologinis skaidymas, cheminė sintezė, modifikuoti pirimidinai, uracilas, uracilo auksotrofai. Anotacija (užsienio k.) During the final bachelor thesis, modified pyrimidine heterocyclic bases were chemically synthesized and their catabolism was studied. The synthesis was based on literature or on previous experiments and the purity of the compounds was determined by NMR, HPLC and UV/Vis analysis. In total of seven compounds have been synthesized with modifications at the 2nd and/or 4th positions. Also, the biodegradation of the sythesized compounds was carried out with uracil auxotrophic E. coli ?pyrF bacteria. During this experiment it was found that these bacteria are only able to convert 2,4-dichloropyrimidine and 4-chloro-2-methylthiopyrimidine to unmodified uracil. The thesis consists of six parts: introduction, litreture review, materials and methods, results and their discussion, conclusions, list of references, appendices. Scope of work: 38 pages without appendices, 11 illustrations, 4 tables, 32 bibliographic sources. Appendices are attached separately. Raktiniai žodžiai: biodegradation, chemical synthesis, modified pyrimidines, uracil, uracil auxotrophs.
Studento vardas, pavardė Irmantas Prajara	Baigiamojo darbo pavadinimas Periferinio kraujo plazmos ir mononuklearinių ląstelių kombinuoto paruošimo metodo sukūrimas	Baigiamojo darbo vadovas Mantas Minkauskas
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame darbe buvo palyginti tradiciniu (atskiru) ir kombinuotu metodu grynintų periferinio kraujo mononuklearinių ląstelių (PBMC) ir kraujo plazmos rodikliai ląstelės ir molekuliniame lygmenyje, įvertintas kombinuoto metodo atkartojamumas taikant GAGE R&R Anova metodą. Literatūros apžvalgoje apžvelgta literatūra, kurioje yra aprašomi: biobankai, kraujas ir kraujo tyrimai, PBMC, kraujo plazma, tradiciniai plazmos ir PBMC ruošimo metodai. Metodikos dalyje buvo atlikti PBMC ir plazmos gryninimai tradiciniu ir kombinuotu metodais, RNR gryninimas ir kokybės nustatymas. Metodų palyginimas ir kombinuoto metodo atkartojamumas nustatytas vykdant statistinę duomenų analizę. Darbo metu buvo nustatyta, jog tradicinis ir kombinuotas metodas yra lygiaverčiai, taip pat nustatyta skirtingų dispersijos šaltinių įtaka PBMC gryninimo kokybei ir biocheminių plazmos tyrimų rezultatams. Raktiniai žodžiai: Periferinio kraujo mononuklearinės ląstelės, kraujo plazma, RNR, tradicinis plazmos gryninimo metodas, kombinuotas gryninimo metodas, metodo atkartojamumas, GAGE R&R Anova. Anotacija (užsienio k.) In the final thesis, the indicators of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and blood plasma purified using traditional (separate) and combined methods were compared at the cellular and molecular levels. The repeatability of the combined method was assessed using the GAGE R&R ANOVA method. The literature review covers sources discussing biobanks, blood and blood analysis, PBMCs, blood plasma, and traditional methods of preparing plasma and PBMCs. In the methodology section, purification of PBMCs and plasma using traditional and combined methods, RNA purification, and quality assessment were performed. The comparison of methods and the repeatability of the combined method were determined through statistical data analysis. The study concluded that the traditional and combined methods are equivalent and that different sources of variance affect the quality of PBMC purification and the results of biochemical plasma tests. Raktiniai žodžiai: Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), blood plasma, RNR, traditional plasma purification method, traditional PBMC purification method, combined purification method, repeatability of the method, GAGE R&R Anova.
Studento vardas, pavardė Vestina Steigvilaitė	Baigiamojo darbo pavadinimas Dihidrouracilo oksidazių fermentinių aktyvumų palyginimas mielėse ir bakterijose	Baigiamojo darbo vadovas dr. Augusta Ivaškė
Anotacija (lietuvių k.) Visi RNR nukleozidai gali būti modifikuojami, jų modifikacijos yra svarbios reguliuojant RNR funkcijas bei stabilumą. Nustatyta daugiau nei 170 skirtingų RNR modifikacijų tipų, daugiausia jų aptinkama tRNR. Atlikta nemažai tyrimų, analizuojančių RNR modifikacijų susidarymą bei šias reakcijas katalizuojančius fermentus, tačiau informacijos apie modifikuotų nukleozidų ir atitinkamų heterociklinių bazių skaidymą yra kur kas mažiau. Dihidrouracilo oksidazės – tai neseniai atrasti nuo flavino priklausomi fermentai, kurie katalizuoja dihidrouracilo virtimo uracilu reakciją. Nustatyta, jog mielių Alternaria alternata genai koduoja aktyvias dihidrouracilo oksidazes. Baigiamajame bakalauro darbe palyginami dihidrouracilo oksidazių fermentiniai aktyvumai mielėse ir bakterijose. Taikant plonasluoksnės chromatografijos metodą, buvo nustatyta, jog Escherichia coli, Bacillus subtilis ir Salmonella typhi bakterijų kamienuose nėra dihidrouracilo oksidazių, pasižyminčių fermentiniu aktyvumu. Į E. coli auksotrofinius kamienus buvo įterpiami Alternaria alternata ir Haemophilus paraculiculus dihidrouracilo oksidazės genai, tačiau augimo fenotipo komplementacija įvyko tik su A. alternata genu. Buvo atliekama rekombinantinės A. alternata dihidrouracilo oksidazės indukcija, optimizuojant geno raiškos sąlygas. Sėkmingai atlikus A. alternata dihidrouracilo oksidazės mutagenezę, iš išaugusių transformantų išskiriamos plazmidės, kurios buvo įvedamos į Escherichia coli uracilo auksotrofinius kamienus, atliekama augimo fenotipo komplementacija bei tikrinamas jų fermentinis aktyvumas. Gauti rezultatai parodė, jog komplementacija su mutacijas turinčiais genais neįvyko, taip pat jie nepasižymėjo fermentiniu aktyvumu. Darbą sudaro 6 dalys: įvadas, literatūros analizė, medžiagos ir tyrimo metodai, rezultatai ir jų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas. Darbo apimtis – 62 p. teksto be priedų, 30 iliustr., 13 lent., 46 bibliografiniai šaltiniai. Raktiniai žodžiai: dihidrouracilo oksidazė, Alternaria alternata, Haemophilus paracuniculus, uracilo auksotrofai, mutagenezė, fenotipo komplementacija, fermentinis aktyvumas, rekombinantinių baltymų raiška, plazmidė. Anotacija (užsienio k.) All RNA nucleosides can be modified, and these modifications are important for regulating RNA functions and stability. More than 170 different types of RNA modifications have been identified, most of which are found in tRNA. A considerable amount of research has been conducted analyzing the formation of RNA modifications and the enzymes that catalyze these reactions; however, there is significantly less information about the degradation of modified nucleosides and their corresponding heterocyclic bases. Dihydrouracil oxidases are recently discovered flavin-dependent enzymes that catalyze the conversion of dihydrouracil to uracil. It has been determined that genes from the yeast Alternaria alternata encode active dihydrouracil oxidases. In the final bachelor's thesis, the enzymatic activities of dihydrouracil oxidases from yeast and bacteria were compared. Using the thin-layer chromatography method, it was found that Escherichia coli, Bacillus subtilis, and Salmonella typhi strains do not contain dihydrouracil oxidases exhibiting enzymatic activity. Genes encoding dihydrouracil oxidases from Alternaria alternata and Haemophilus paraculiculus were inserted into uracil auxotrophic E. coli strains; however, phenotypic growth complementation occurred only with the A. alternata gene. Recombinant expression of A. alternata dihydrouracil oxidase was induced by optimizing gene expression conditions. After successfully performing mutagenesis of the A. alternata dihydrouracil oxidase gene, plasmids were isolated from the resulting transformants and introduced into Escherichia coli uracil auxotrophic strains. Phenotypic growth complementation and enzymatic activity tests were conducted. The results showed that complementation with the mutated genes did not occur, and the mutated genes also did not exhibit enzymatic activity. Structure: introduction, literature review, materials and methods, results and discussion, conclusions, references. Thesis consists of: 62 pages, 30 pictures, 13 tables, 46 references. Raktiniai žodžiai: dihydrouracil oxidase, Alternaria alternata, Haemophilus paracuniculus, uracil auxotrophs, mutagenesis, phenotypic complementation, enzymatic activity, recombinant protein expression, plasmid.
Studento vardas, pavardė Iris Mato	Baigiamojo darbo pavadinimas Natūralių maisto papildų „CAMELYN“ (medaus ekstrakto) ir spirulinos priešvėžinių savybių vertinimas in vitro tyrime	Baigiamojo darbo vadovas dr. Eglė Strainienė
Anotacija (lietuvių k.) Bakalauro baigiamajame darbe įvertintos natūralių maisto papildų „Camelyn“ medaus ekstrakto ir Spirulina Platensis (Spirulina) priešvėžinės savybės taikant in vitro metodus. Tyrimuose naudoti vėžinių ir nevėžinių ląstelių gyvybingumo bei klonogeniniai testai. Rezultatai statistiškai išanalizuoti, siekiant įvertinti selektyvų citotoksiškumą. Išvados atskleidžia šių papildų terapinį potencialą ir pateikia rekomendacijas tolesniems biomedicininiams tyrimams. Struktūra: įvadas, literatūros apžvalga, medžiaga ir metodai, rezultatai, išvados ir pasiūlymai, literatūros sąrašas, priedai. Darbo apimtis: 35 psl. be priedų, 27 paveikslai, 3 lentelės, 36 literatūros šaltiniai. Raktiniai žodžiai: Camelyn, vėžinės ląstelės, ląstelių gyvybingumas, klonogeninis tyrimas, medaus ekstraktas, in vitro tyrimas, natūralūs papildai, Spirulina Platensis (Spirulina), statistinė analizė, terapinis potencialas. Anotacija (užsienio k.) In the final bachelor's thesis it is evaluated the anti-cancer properties of natural food supplements Camelyn honey extract and Spirulina Platensis (Spirulina) using in-vitro methods. It includes cell viability and clonogenic assays on cancerous and non-cancerous cell lines. Results are analyzed statistically, highlighting selective cytotoxicity. Conclusions summarize therapeutic potential and propose further biomedical research directions. Structure: introduction, literature review, materials and mehtods, results, conclusions and suggestions, references, annexes. Thesis consist of: 35 p. text without appendixes, 27 pictures, 3 tables, 36 bibliographical entries. Raktiniai žodžiai: Camelyn, Cancer cells, Cell viability, Clonogenic assay, Honey extract, In-vitro study, Natural supplements, Spirulina Platensis (Spirulina), Statistical analysis, Therapeutic potential
Studento vardas, pavardė Dagnė Norvaišaitė	Baigiamojo darbo pavadinimas Saccharomyces cerevisiae-grįsto bioanodo modifikavimas platinos mikrostruktūromis ir anglies nanomedžiagomis mikrobinio biokuro elementų optimizavimui	Baigiamojo darbo vadovas dr. Antanas Zinovičius
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame bakalauro darbe konstruojami keturi Saccharomyces cerevisiae-grįsto bioanodo modifikacijos variantai, naudojant platinos nanodaleles, platinos mikrostruktūras, redukuotą grafeno oksidą bei anglies nanovamzdelius. Literatūros analizės dalyje gilinamąsi į mikrobinio biokuro elemento konstrukciją, elemente vykstančias elektrochemines reakcijas ir jo panaudojimo būdus. Metodikos dalyje aprašomas mediatorių ir naudojimų medžiagų paruošimas, elemento elektrolito sudėtis, mielių auginimas, elektrodo paruošimas, pasirinktų nanokompozitų imobilizavimas, skenuojantis elektronus mikroskopas, ciklinės voltamperometrijos panaudojimas, Hill lygties panaudojimas nustatant minimalią gliukozės koncentraciją, nuo kurios mikrobinio biokuro elemento generuojama galia tampa nepriklausoma nuo koncentracijos pokyčių, sugeneruotos galios skaičiavimai pritaikant skirtingas varžos vertes. Rezultatuose aptariami lipofilinių mediatorių ciklinės voltamperometrijos grafikai, gauti mikrobinio biokuro elemento modifikuotų nanokompozitais anodų rezultatai ir galios tankio skaičiavimai. Taip pat pateikiamos išvados apie pavykusius ir nepavykusius matavimus. Darbą sudaro septynios dalys: įvadas, literatūros analizė, medžiagos ir metodai, skaičiavimai, rezultatai, išvados ir literatūros sąrašas. Darbe yra 22 iliustracijos ir šešios lygtys. Raktiniai žodžiai: Saccharomyces cerevisiae, anodas, elektrodas, mikrobinis biokuro elementas, ciklinė voltamperometrija, Hill lygtis, mediatorius, nanokompozitai, galios tankis, varža. Anotacija (užsienio k.) In the final bachelor's thesis, four modifications of the Saccharomyces cerevisiae-based bioanode are constructed using platinum nanoparticles, platinum microstructures, reduced graphene oxide and carbon nanotubes. The literature analysis part delves into the construction of the microbial biofuel cell, the electrochemical reactions occurring in the cell and its application methods. The methodology part describes the preparation of mediators and materials, the composition of the cell electrolyte, yeast cultivation, electrode preparation, immobilization of selected nanocomposites, scanning electron microscope, use of cyclic voltammetry, use of the Hill equation to determine the minimum glucose concentration at which the power generated by the microbial biofuel cell becomes independent of concentration changes, calculations of the generated power by applying different resistance values. The results discuss the cyclic voltammetry graphs of lipophilic mediators, the results obtained for the anodes of the microbial biofuel cell modified with nanocomposites and power density calculations. Conclusions on successful and unsuccessful measurements are also presented. The work consists of seven parts: introduction, literature analysis, materials and methods, calculations, results, conclusions and references. The work contains 22 illustrations and six equations. Raktiniai žodžiai: Saccharomyces cerevisiae, anode, electrode, microbial biofuel cell, cyclic voltammetry, Hill equation, mediator, nanocomposites, power density, varža
Studento vardas, pavardė Domantas Barkauskas	Baigiamojo darbo pavadinimas Ensifer meliloti bakterijų taikymas mikrobiniuose kuro elementuose	Baigiamojo darbo vadovas doc. dr. Inga Morkvėnaitė-Vilkončienė
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame bakalauro darbe tiriamas Ensifer meliloti bakterijų taikymas, kuriant mikrobines kuro elemento sistemas. Jų elektrocheminis efektyvumas įvertinamas naudojant skirtingus redokso mediatorius: 9, 10 - fenantrenochinoną, 1,4 – benzochinoną ir hidrochinoną. Bakterijos buvo imobilizuotos ant grafito elektrodo, o jų sąveika su juo įvertinta pasiremiant cikline voltamperometrija bei naudojant multimetrą, apskaičiuojant galią. Įvertina optimali mediatorių koncentraciją 0.064 mM. Rezultatai taip pat parodė, kad efektyviausias mediatorius 9,10 – fenantrenochinonas, sugeneravęs didžiausius elektros srovės tankius bei didžiausias galios vertes, hidrochinono reikšmės buvo prasčiausios. Darbas pažymi redokso mediatorių reikšmė elektronų pernašoje bei Ensifer meliloti bakterijų taikymą, bioelektrocheminėse sistemose. Darbą sudaro 7 dalys: įvadas, literatūros apžvalga, tyrimo metodika, tyrimo rezultatai ir jų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas ir priedai Darbo apimtis – 41p. teksto be priedų, 14 iliustr., 47 bibliografiniai šaltiniai. Raktiniai žodžiai: Ensifer meliloti, mikrobiniai kuro elementai, redokso mediatoriai, ciklinė voltamperometrija, PQ, BQ, HQ Anotacija (užsienio k.) The bachelor's thesis investigates the application of Ensifer meliloti bacteria in the development of microbial fuel cell systems. Their electrochemical efficiency is evaluated using different redox mediators: 9,10-phenanthrenequinone, 1,4-benzoquinone, and hydroquinone. The bacteria were immobilized on a graphite electrode, and their interaction with the electrode was assessed using cyclic voltammetry and a multimeter by calculating the generated power. The optimal mediator concentration of 0.064 mM was determined. The results also showed that 9,10-phenanthrenequinone was the most effective mediator, generating the highest current densities and power values, while hydroquinone showed the lowest performance. The study highlights the role of redox mediators in electron transfer and the applicability of Ensifer meliloti in bioelectrochemical systems. The thesis consists of six sections: introduction, literature review, research methodology, research results and discussion, conclusions, and references. The thesis comprises 41 pages of text excluding appendices, 14 illustrations, 47 bibliographic references and apendix Raktiniai žodžiai: Ensifer meliloti, microbial fuel cells, redox mediators, cyclic voltammetry, PQ, BQ, HQ
Studento vardas, pavardė Vėjas Strelčiūnas	Baigiamojo darbo pavadinimas Fermentinio elektrodo su tetrazolio druskomis tyrimas	Baigiamojo darbo vadovas doc. dr. Rūta Ivanec-Goranina
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame bakalauro darbe tiriamos penkios tetrazolio druskos – MTT, XTT, WST-1, WST-3 ir WST-8 – kaip elektrocheminiai mediatoriai fermentinio biojutiklio pagrindu. Tyrimo tikslas – įvertinti šių junginių elektrochemines ir optines savybes bei jų tinkamumą elektronų pernašai, katalizuojamai diaforazės fermento. Tyrime buvo taikyti ciklinės ir linijinės voltamperometrijos bei chronoamperometrijos metodai, taip pat spektrofotometrinė analizė, kuria patvirtintas formazanų susidarymas. Taip pat įvertintas NADH oksidacijos sukelto elektrocheminio atsako pokytis, apskaičiuotas sistemų jautris ir oksidacijos potencialo poslinkis. Gauti rezultatai parodė, kad efektyviausi mediatoriai NADH detekcijos požiūriu buvo MTT ir XTT – sistemos su šiais junginiais demonstravo didžiausią generuojamos srovės stiprio pokytį bei pasižymėjo didžiausiu elektrocheminiu jautriu. Tyrimo duomenys leidžia spręsti apie tetrazolio junginių tinkamumą panaudojant jas kaip elektronų pernašos mediatorius fermentiniuose biojutikliuose ir gali būti naudingi kuriant efektyvesnes analitines sistemas NADH ir kitų elektrochemiškai aktyvių junginių aptikimui. Darbą sudaro 7 dalys: įvadas, literatūros apžvalga, tyrimo medžiagos ir metodai, tyrimo rezultatai ir jų aptarimas, išvados, naudotos literatūros sąrašas, priedai. Darbo apimtis: 57 psl. be priedų, 27 paveikslai, 6 lentelės, 76 bibliografiniai šaltiniai. Atskirai pridedami darbo priedai. Raktiniai žodžiai: elektrocheminis biojutiklis, tetrazolio druska, formazanas, diaforazė, ciklinė voltamperometrija, linijinė voltamperometrija, chronoamperometrija, redokso reakcija Anotacija (užsienio k.) This bachelor's thesis investigates five tetrazolium salts – MTT, XTT, WST-1, WST-3, and WST-8 – as electrochemical mediators in an enzymatic biosensor system. The aim of the study is to evaluate the electrochemical and optical properties of these compounds and their suitability for electron transfer catalyzed by the diaphorase enzyme. The study employed cyclic and linear voltammetry as well as chronoamperometry methods, along with spectrophotometric analysis to confirm formazan formation. Additionally, changes in electrochemical response induced by NADH oxidation were assessed, the sensitivity of each system was calculated, and oxidation potential shifts were determined. The results showed that MTT and XTT were the most effective for NADH detection, as systems containing these compounds demonstrated the highest current response and the greatest electrochemical sensitivity. The findings suggest that tetrazolium salts are suitable mediators for electron transfer in enzymatic biosensors and may contribute to the development of more efficient analytical systems for detecting NADH and other electrochemically active compounds. The thesis consists of 7 parts: introduction, literature review, materials and methods of the study, results and their discussion, conclusions, list of references used, appendices. Volume of the thesis: 57 pages without appendices, 27 figures, 6 tables, 76 bibliographic sources. Annexes to the work are attached separately. Raktiniai žodžiai: electrochemical biosensor, tetrazolium salt, formazan, diaphorase, cyclic voltammetry, linear sweep voltammetry, chronoamperometry, redox reaction
2025 metų magistro baigiamųjų darbų anotacijos
Studento vardas, pavardė Vytautas Valentinas	Baigiamojo darbo pavadinimas Skaidančių naftos produktus ir teršalus mikroorganizmų identifikavimas ir fermentinių aktyvumų tyrimas	Baigiamojo darbo vadovas dr. Dovilė Vasiliauskienė
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame magistro darbe tirtos bakterijos, galinčios skaidyti naftos produktų ir kreozoto mišinį, kuriuo būdavo impregnuojami mediniai geležinkelio pabėgiai. Siekiant sumažinti naftos produktų taršą dirvožemyje ar vandenyje, pasitelkiama bioremediacija, kuri remiasi, mikroorganizmų gebėjimu skaidyti teršalus, paverčiant juos mažiau kenksmingais junginiais. Teorinėje dalyje aptariami naftos produktų ir kreozoto keliami pavojai bei nauda, taip pat bioremediacijos metodai, mikroorganizmų naudojimas šiems teršalams skaidyti bei biologinės kilmės paviršiaus aktyvumo medžiagų klasifikacija. Eksperimentinėje dalyje identifikuotos bakterijų rūšys, galinčios ardyti naftos produktus ir kreozotą, įvertintas jų gebėjimas gaminti biologinės kilmės paviršiaus aktyvumo medžiagas ir nustatytas bendras lipazinis aktyvumas. Ištirti susmulkintų mediniai pabėgių pokyčiai po inkubacijos su mikroorganizmais taikant Furjė transformacijos infraraudonųjų spindulių spektroskopiją. Remiantis tyrimo rezultatais, nustatyta, kad naudotos bakterijų rūšys optimaliomis sąlygomis geba sintetinti biosurfaktantus ir ardyti angliavandenilius, kuriais būdavo impregnuoti mediniai pabėgiai. Darbą sudaro 7 dalys: įvadas, literatūrinė analizė, metodinė dalis, tyrimo rezultatai bei jų aptarimas, išvados, darbe naudotas literatūros sąrašas, priedai. Darbo apimtis: 68 psl. be priedų, 20 iliustr., 10 lent., 90 bibliografinių šaltinių. Raktiniai žodžiai: bioremediacija, bakterijos, biologinės kilmės paviršiaus aktyvumo medžiagos, fermentinis aktyvumas. Anotacija (užsienio k.) This master thesis investigates bacteria that can degrade a mixture of petroleum products and creosote used to impregnate wooden railway sleepers. To reduce the contamination of petroleum products in soil or water, bioremediation is used. This process is based on the ability of microorganisms to break down pollutants into less harmful compounds. The theoretical part discusses the risks and benefits of petroleum products and creosote, as well as bioremediation methods, the use of microorganisms to degrade these pollutants, and the classification of biosurfactants. In the experimental part, bacterial species capable of degrading petroleum products and creosote were identified, their ability to produce biosurfactants was evaluated, and their total lipase activity was measured. Changes in the shredded wooden sleepers after incubation with microorganisms were investigated by Fourier transform infrared spectroscopy. The results show that the bacterial species are able, under optimal conditions, of synthesis of biosurfactants and to degrade the hydrocarbons with which the wooden sleepers were impregnated. Thesis structure: introduction, literature review, methodology, results and discussion, conclusions, references, appendices. Thesis consists of: 68 p. text without appendices, 20 pictures, 10 tables, 90 bibliographical entries. Raktiniai žodžiai: bioremediation, bacteria, biosurfactants, enzymatic activity.
Studento vardas, pavardė Austėja Burbulytė	Baigiamojo darbo pavadinimas Kintančių parametrų įtakos mikroplastiko sorbcijai, naudojant lignino nanosorbentus, tyrimas	Baigiamojo darbo vadovas prof. dr. Jaunius Urbonavičius
Anotacija (lietuvių k.) Mikroplastiko dalelių keliamos rizikos skatina tirti jų šalinimo iš aplinkos būdus. Efektyviam mikroplastiko dalelių šalinimui iš vandens galima taikyti sorbcijos metodą naudojant gamtines nanomedžiagas. Baigiamajame magistro darbe tiriama kintančių parametrų įtaka polietileno granulių (2 mm) sorbcijai naudojant lignino nanosorbentus: ligniną ir ligniną-Fe3O4. Keičiant sorbcijos parametrus: laiką, pH, nanomedžiagos kiekį, polietileno granulės masę, H2O tūrį, įvertintas sorbcijos efektyvumas. Laiko pokytis padidino abiejų nanomedžiagų sorbcijos efektyvumą. Nustatyta palanki pH terpė sorbcijai vykti svyruoja nuo pH 5 iki pH 7. Nanomedžiagos kiekio didinimas sumažino sorbcijos efektyvumą. Polietileno granulės masės ir H2O tūrio pokytis turėjo daugiau įtakos lignino sorbcijos efektyvumui. Sorbcijos kinetikos ir izotermos modeliai parodė, kad lignino, lignino-Fe3O4 ir polietileno granulės paviršiuje dominuoja cheminės jėgos, tokios kaip hidrofobinė sąveika, kompleksavimas. Taip pat sorbcijos metu gali veikti fizikinės jėgos, silpna elektrostatinė sąveika ir van der Waals jėgos. Darbą sudaro 7 dalys: įvadas, literatūros apžvalga, medžiagos ir metodai, rezultatai ir jų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas, padėka. Darbo apimtis – 54 p. teksto be priedų, 19 paveikslų, 5 lentelės, 84 bibliografiniai šaltiniai. Atskirai pridedami priedai. Raktiniai žodžiai: Mikroplastiko dalelės, polietileno granulė, ligninas, ligninas-Fe3O4, sorbcija, sorbcijos efektyvumas Anotacija (užsienio k.) The potential risks of microplastic particles have encouraged the development of research methods for their removal from the environment. To effectively remove these particles from water, a sorption method using natural nanomaterials can be applied. This study investigates the influence of changing parameters on the sorption of polyethylene granules (2 mm) using lignin nanosorbents: lignin and lignin-Fe3O4. Polyethylene is one of the most widely distributed microplastics in the environment, especially in water. In this study the sorption efficiency was evaluated by changing the sorption parameters: time, pH, nanomaterial amount, H2O volume, and polyethylene granule mass. Time changes increase the sorption efficiency of both materials. The optimal pH range for sorption was determined to be from pH 5 to pH 7. Sorption efficiency decreases with increasing amounts of nanomaterials. In contrast, increasing the mass of polyethylene granule has a more influence on lignin sorption. Variations in H2O volume, also, have more impact to lignin sorption system. Sorption kinetics and isotherm models show that chemical forces, such as hydrophobic interactions and complexation, dominate the surfaces of lignin, lignin-Fe3O4 and polyethylene granules. Additionally, physical forces, including weak electrostatic interactions, and van der Walls forces may also contribute to the sorption process. The work consists of 7 parts: introduction, literature review, materials and methods, results and their discussion, conclusions, references, acknowledgements. Theses consist of 54 pages of text without appendices, 19 figures, 5 tables, 84 bibliographical sources. Appendices included. Raktiniai žodžiai: Microplastic particles, polyethylene granule, lignin, lignin-Fe3O4, sorption, sorption efficiency
Studento vardas, pavardė Edita Masėnaitė	Baigiamojo darbo pavadinimas Bst DNR polimerazės kryptinga mutagenezė	Baigiamojo darbo vadovas doc. dr. Elena Servienė
Anotacija (lietuvių k.) Bst DNR polimerazė yra naudojama izoterminiam nukleorūgščių padauginimui. Pagrindinis tokių metodų trūkumas - nespecifinės reakcijos, kurios gali lemti klaidingai teigiamus rezultatus. Literatūroje teigiama, kad nespecifines reakcijas lemia Bst nukleotidų prijungimas 3'-gale. Šio darbo tikslas sukurti ir ištirti Bst DNR polimerazės mutantus, kurie galėtų sumažinti nukleotidų prijungimą 3'gale. Darbą sudaro 8 dalys: įvadas, literatūrinė dalis, metodinė dalis, tyrimo rezultatai bei jų aptarimas, išvados, darbe naudotos literatūros sąrašas ir padėka. Darbo apimtis – 93 p. teksto be priedų, 43 iliustr., 24 lent., 93 bibliografinių šaltinių. Atskirai darbo priedai nėra pridedami. Raktiniai žodžiai: LAMP, Bst DNR polimerazė, uodeginimas, nukleorūgščių padauginimas, izoterminė amplifikacija. Anotacija (užsienio k.) Bst DNA polymerase is used for isothermal amplification of nucleic acids. The main disadvantage of such methods is the non-specific reactions which can lead to false positive results. The literature suggests that the non-specific reactions are due to the addition of Bst nucleotides at the 3'-end. The aim of this work is to develop and test Bst DNA polymerase mutants that can reduce nucleotide binding at the 3'end. Thesis structure: introduction, literature review, methodology, results and discussion, conclusions, references, acknowledgements, appendices. Thesis consist of: 93 p. Text without appendices, 43 pictures, 24 tables, 93 bibliographical entries. Appendices are not included. Raktiniai žodžiai: LAMP, Bst DNA polymerase, tailing, nucleic acid amplification, isothermal amplification.
Studento vardas, pavardė Justina Gustaitytė	Baigiamojo darbo pavadinimas Neturinčios N-galinio domeno Taq DNR polimerazės tobulinimas	Baigiamojo darbo vadovas doc. dr. Elena Servienė
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame magistro darbe atliktas Taq DNR polimerazės, neturinčios N-galinio domeno, tobulinimas in vitro evoliucijos metodu ir žinomo sutrumpintos Taq DNR polimerazės mutanto charakterizavimas. Teorinėje darbo dalyje aptariamos Taq DNR polimerazės savybės, mutantinių fermentų atranka taikant in vitro evoliucijos metodą. Analitinėje darbo dalyje atliktas mutantinių sutrumpintų Taq DNR polimerazių bibliotekų konstravimas, aktyvių mutantinių polimerazių atranka taikant savireplikacijos erdvėskyroje metodą ir žinomo sutrumpintos Taq DNR polimerazės mutanto savybių tyrimas. Atlikus šį tyrimą buvo sukurta ir atrinkta aktyvių mutantinių sutrumpintų Taq DNR polimerazių biblioteka ir ištirtos Taq DNR polimerazės mutanto savybės tokios kaip: DNR sintezės greitis, atsparumas inhibitoriams, gebėjimas atlikti daugybinę PGR. Darbą sudaro 6-ios dalys: įvadas; literatūros apžvalga; medžiagos, metodai; rezultatai ir jų aptarimas; išvados; literatūros sąrašas. Darbo apimtis – 70 p. teksto be priedų, 27 pav., 19 lentelių., 50 bibliografiniai šaltiniai. Raktiniai žodžiai: sutrumpinta Taq DNR polimerazė, sutrumpintos Taq DNR polimerazės mutantas, bibliotekų konstravimas, elektroporacija, inhibitoriai, PGR, mutantinių polimerazių atranka, daugybinė PGR. Anotacija (užsienio k.) This Master thesis described the improvement of Taq DNA polymerase lacking the N-terminal domain using the in vitro evolution method and the characterization of a known Taq DNA polymerase mutant. Literature review consists the properties of Taq DNA polymerase and the selection of mutant enzymes using the in vitro evolution method. The analytical part of the thesis includes the construction of mutant Taq DNA polymerase libraries, the selection of active mutant polymerases using the compartmentalized self-replication method and the study of the properties of a known Taq DNA polymerase mutant with N-terminal deletion. As a result of this thesis, a library of active Taq DNA polymerases mutant was created and selected also Taq DNA polymerases mutant was characterased (DNA synthesis rate, resistance to inhibitors and ability to perform multiplex PCR). Thesis consists of 6 parts: introduction, literature review, methodology, results and discussion, conclusion, references. Work scope – 70 pages. text without appendices, 27 figures, 19 tables, 50 bibliographical entries. Raktiniai žodžiai: Taq DNA polymerase with N-terminal deletion, Taq DNA polymerase mutant, library construction, electroporation, inhibitors, PCR, selection of mutant polymerases, multiplex PCR.
Studento vardas, pavardė Yasmine Hassan Mohamed Rezk	Baigiamojo darbo pavadinimas Ląstelių technologijos vėžio imunoterapijos modeliavimo tyrimams in vitro	Baigiamojo darbo vadovas dr. Agata Mlynska
Anotacija (lietuvių k.) 3 Vilniaus Gedimino technikos universitetas Fundamentinių mokslų fakultetas Chemijos ir bioinžinerijos katedra ISBN _______ ISSN _______ Egz. sk. ……….. Data ….-….-…. Bioinžinerijos studijų programos baigiamasis magistro darbas Pavadinimas Ląstelių technologijos vėžio imunoterapijai in vitro modeliuoti Autorius Yasmine Hassan Mohamed Rezk Vadovas Dr. Agata Mlynska Kalba: anglų Anotacija Magistro darbe analizuojama, kaip skirtingų kiaušidžių navikų imuninių potipių lizatų poveikis veikia iš sveikų donorų periferinio kraujo diferencijuotų monocitinės kilmės dendritinių ląstelių (moDC) fenotipą ir brendimą in vitro sąlygomis. Teorinėje dalyje aptariamas kiaušidžių vėžio imuninis heterogeniškumas bei ribotas atsakas į standartines imunoterapijas. Eksperimentuose naudoti sveikų donorų monocitai, diferencijuoti į moDC, 3 dienas veikiant GM-CSF ir IL-4 citokinais, o vėliau stimuliuoti lizatais, priskirtais uždegiminiam, imunologiškai atribotam ir imuninės dykumos potipiams. Taikyta tėkmės citometrija ir transkriptominė CIBERSORTx analizė, siekiant įvertinti paviršinių žymenų raišką ir imuninio profilio pokyčius. Rezultatai parodė, kad skirtingi imuninio potipio lizatai sukelia skirtingas DC brendimo reakcijas – imuninės dykumos navikų lizatai skatina labiausiai išreikštą subrendimo fenotipą, o uždegiminiai lizatai – transkriptominę imuninę aktyvaciją. Darbas išryškina personalizuotų DC vakcinų plėtros būtinybę. Darbą sudaro …. dalys: įvadas, literatūrinė dalis, metodinė dalis, tyrimo rezultatai bei jų aptarimas, išvados, darbe naudotos literatūros sąrašas, priedai. Darbo apimtis: 68 psl. be priedų, 28 iliustr., 6 lent., 61 bibliografinių šaltinių. Atskirai pridedami darbo priedai. Raktiniai žodžiai: Reikšminiai žodžiai: ląstelių imunoterapija, dendritinės ląstelės, kiaušidžių vėžys, imuninis potipis, vakcinos, srautinė citometrija, CIBERSORTx Anotacija (užsienio k.) Annotation This master’s thesis investigates the influence of immune-subtype-specific ovarian tumor lysates on the phenotype and maturation of monocyte-derived dendritic cells (moDCs) in vitro. The background highlights ovarian cancer’s immunological heterogeneity and poor responsiveness to standard immunotherapies. The experimental work involved generating moDCs from healthy donors using a short GM-CSF and IL-4 protocol, followed by stimulation with tumor lysates classified into inflamed, immune-excluded, and immune-desert categories. Flow cytometry and transcriptomic (CIBERSORTx) analyses were used to evaluate DC surface marker expression and immune profile modulation. Results showed that each immune subtype induced distinct DC maturation signatures, with immune-desert lysates enhancing phenotypic markers and inflamed lysates promoting transcriptomic immune activation. The findings underline the necessity for personalized DC-based immunotherapies tailored to tumor immune subtype. Thesis structure: introduction, literature review, methodology, results and discussion, conclusions, references, appendices. This thesis consists of 68 pages of text without appendices, 28 figures, 6 tables, 61 bibliographical entries. Appendices are included. Raktiniai žodžiai: Keywords: ovarian cancer, dendritic cells, immunotherapy, tumor microenvironment, immune subtypes, flow cytometry, transcriptomics, vaccines
Studento vardas, pavardė Domas Štitilis	Baigiamojo darbo pavadinimas MiRNR ir jų genų taikinių raiškos vaidmuo prognozuojant trigubai neigiamą krūties vėžio eigą	Baigiamojo darbo vadovas dr. Eglė Strainienė
Anotacija (lietuvių k.) Trigubai neigiamas krūtų vėžys (TNKV) – piktybiškiausia krūties vėžio forma, gydoma neoadjuvantine chemoterapijos ir chirurginės intervencijos būdu. Baigiamojo magistro darbo tikslas buvo ištirti pasirinktų miRNR raišką krūties vėžio pacientų kraujo klinikiniuose ėminiuose ir susieti šiuos duomenis su klinikine diagnoze. Teorinėje darbo dalyje pateikiama TNKV charakteristika ir gydymo schemos, miRNR biogenezė, tikslinių miRNR bei jų genų taikinių funkcijos ir signaliniai keliai ir biologiniai procesai svarbūs TNKV. Metoduose detaliai aprašomos atliktos bioinformatinės analizės ir ?C_T vertinimo būdas, kuriam apskaičiuoti naudotas dviejų žingsnių TL-PGR metodas. Gauti ?C_T raiškos pokyčiai atvaizduoti grafiškai ir įvertintas statistinis reikšmingumas. Tyrimo metu paaiškėjo, kad TNKV pacienčių kraujo ėminiuose reikšmingai keičiasi onkogeninių ir naviką slopinančių miRNR raiška. Bioinformatinės analizės metu pavyko nustatyti tikslinių miRNR genus taikinius ir signalinius kelius, kuriuose jie dalyvauja. Darbą sudaro 8 dalys: įvadas, literatūrinė dalis, metodinė dalis, tyrimo rezultatai, diskusija, išvados, darbe naudotos literatūros sąrašas, priedai. Darbo apimtis: 79 psl. be priedų, 26 pav., 4 lent., 77 bibliografinių šaltinių. Atskirai pridedami darbo priedai. Raktiniai žodžiai: TNKV, miRNR, neoadjuvantinė chemoterapija. Anotacija (užsienio k.) Triple-negative breast cancer (TNBC) is the most malignant form of breast cancer, treated with neoadjuvant chemotherapy and surgery. The aim of the final Master's thesis was to investigate the expression of selected miRNAs in clinical blood samples of breast cancer patients and to correlate these data with clinical diagnosis. The theoretical part of the thesis presents the characterisation and treatment regimens of NSCLC, the biogenesis of miRNAs, the functions of target miRNAs and their target genes and the signalling pathways and biological processes relevant to NSCLC. The methods describe in detail the bioinformatic analyses performed and the method for estimating ?C_T, which was calculated using a two-step TL-PCR method. The resulting changes in ?C_T expression were plotted graphically and statistical significance was assessed. The study showed significant changes in the expression of oncogenic and tumour suppressor miRNAs in blood samples from TNKV patients. Bioinformatic analysis was able to identify the target genes of the miRNAs and the signalling pathways in which they are involved. The thesis consists of 8 parts: introduction, references, methods, results, discussion, conclusions, list of references, appendices. Volume of the work: 79 pages without appendices, 26 illustrations, 4 tables, 77 bibliographical references. Appendices are attached separately. Raktiniai žodžiai: TNBC, miRNA, neoadjuvant chemotherapy.
Studento vardas, pavardė Povilas Žukauskas	Baigiamojo darbo pavadinimas Polimerinių paviršių modifikavimas naudojant grybinius hidrofobinus bei aukso nanoklasterius	Baigiamojo darbo vadovas prof. dr. Jaunius Urbonavičius
Anotacija (lietuvių k.) Hidrofobinai – išskirtinai filamentiniuose grybuose sintetinami baltymai, kurie pasižymi konservatyviais 4 disulfidiniais tilteliais, savarankiškai formuoja struktūras hidrofilinėje–hidrofobinėje sąsajoje ir gali pakeisti paviršių, ant kurių imobilizuojasi, savybes. Hidrofobinų panaudojimas aktualus audinių inžinerijoje, pristatant vaistus, tvarstant žaizdas, imobilizuojant fermentus. Elektrospiningas – vienas iš gerai žinomų metodų, naudojamų nanopluoštinių karkasų gamyboje bei jų pritaikymui biomedicinos srityje. Elektrospiningo būdu sukurtų polimerinių karkasų paviršių modifikacija naudojant hidrofobinus literatūroje aprašoma kaip teigiamą efektą suteikianti alternatyva trūkumų turintiems polimeriniams karkasams. Baigiamajame magistro darbe buvo tiriami Aspergillus fumigatus hidrofobinai AfRodA ir RodB ir jų savybės. Į raiškai skirtą plazmidę molekulinės biologijos metodais įterptas rodB genas be intronų. Atlikta abiejų baltymų indukcija naudojant IPTG bei gryninimas. Nepavyko pasiekti efektyvios RodB baltymo raiškos E. coli šeimininkėje. Elektrospiningo būdu sukurti ir, naudojant AfRodA baltymą, modifikuoti PHBV karkasų paviršiai, siekiant pagerinti adhezines ir drėkingumo savybes. Atlikti tyrimai eukariotinių ląstelių kultūrose, siekiant įvertinti karkasų paviršiaus modifikacijos įtaką. Darbą sudaro 6 dalys: įvadas, literatūros apžvalga, medžiagos ir tyrimo metodai, rezultatai ir jų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas. Darbo apimtis – 74 p. teksto be priedų, 31 iliustracija, 10 lentelių, 54 bibliografiniai šaltiniai. Raktiniai žodžiai: hidrofobinai, AfRodA, PHBV, elektrospiningas, indukcija, paviršiaus modifikacija. Anotacija (užsienio k.) Hydrophobins are proteins synthesised exclusively in filamentous fungi, which have a conserved sequence of 4 disulfide bridges, self-assemble forming structures at the hydrophilic-hydrophobic interface, and are able to modify the properties of the surfaces on which they are immobilised. The use of hydrophobins is relevant for tissue engineering, drug delivery, wound dressing and enzyme immobilisation. Electrospinning is one of the well-known techniques used for the fabrication of nanofibrous scaffolds and their biomedical applications. The modification of the surfaces of polymeric scaffolds produced by electrospinning using hydrophobins has been described in the literature as a beneficial alternative to flawed polymeric scaffolds. The hydrophobins AfRodA and RodB of Aspergillus fumigatus and their properties were investigated in the final Master‘s thesis. rodB gene without introns was inserted into an expression plasmid using molecular biology techniques. Induction of both proteins using IPTG and purification were performed. Efficient expression of the RodB protein in the E. coli host was not achieved. PHBV scaffolds were produced by electrospinning and modified using the AfRodA protein to enhance adhesion and wettability. Studies in eukaryotic cell cultures have been carried out to assess the impact of surface modification of the scaffolds. The thesis consists of 6 parts: introduction, literature review, materials and methods, results and discussion, conclusions, reference list. The thesis consists of 74 pages of text without appendices, 31 illustrations, 10 tables, 54 bibliographical references. Raktiniai žodžiai: hydrophobins, AfRodA, PHBV, electrospinning, induction, surface modification.
Studento vardas, pavardė Austėja Roberta Bojarinaitė	Baigiamojo darbo pavadinimas Acidogenezės etapo metu išsiskiriančių biodujų kiekybinės ir kokybinės sudėties tyrimai, kai anaerobiniu būdu apdorojamos vaisių ir daržovių atliekos	Baigiamojo darbo vadovas doc. dr. Alvydas Zagorskis
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame magistro darbe nagrinėjami vaisių ir daržovių atliekų susidarymo kiekiai Lietuvos bei pasaulio mastu, jų panaudojimas biodujoms gaminti apdorojant atliekas anaerobiniu būdu. Išnagrinėtos vaisių ir daržovių atliekų charakteristikos, jų fizikiniai ir cheminiai parametrai, anaerobinio apdorojimo proceso etapai, atliekų skaidymo privalumai ir ekonominė nauda bei anaerobiniam procesui reikalingi bioreaktoriaus parametrai. Pateikti acidegenezės etapo metu išsiskiriančių biodujų kiekybinė ir kokybinė sudėtis, kai anaerobiniu būdu apdorojamos vaisių ir daržovių atliekos. Vertinant susidarančių vaisių ir daržovių atliekų kiekius išnagrinėta nauda, kurią būtų galima gauti šias atliekas perdirbant, pateikiamos baigiamojo darbo išvados. Darbą sudaro 6 dalys: įvadas, literatūros apžvalga, medžiagos ir tyrimo metodai, rezultatai ir jų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas. Darbo apimtis – 58 p. teksto be priedų, 37 iliustracija, 13 lentelių, 47 bibliografiniai šaltiniai. Raktiniai žodžiai: vaisių ir daržovių atliekos, acidogenezės etapas, bioreaktorių parametrai. Anotacija (užsienio k.) The final master thesis deals with the quantities of fruit and vegetable waste generation in Lithuania and worldwide, its use in biogas production by anaerobic treatment. The characteristics of fruit and vegetable wastes, their physicochemical parameters, the stages of the anaerobic treatment process, the advantages and economic benefits of waste digestion and the parameters of the bioreactor required for the anaerobic process are analysed. The quantitative and qualitative composition of the biogas produced during the acidogenesis step of anaerobic treatment of fruit and vegetable waste is presented. The quantities of fruit and vegetable waste generated are evaluated, the benefits that could be obtained from the processing of these wastes are analysed, and conclusions of the thesis are presented. The thesis consists of 6 parts: introduction, literature review, materials and methods, results and discussion, conclusions, reference list. The thesis consists of 58 pages of text without appendices, 37 illustrations, 13 tables, 47 bibliographical references. Raktiniai žodžiai: fruit and vegetable waste, acidogenesis step, bioreactor parameters.
Studento vardas, pavardė Artūras Bartiukas	Baigiamojo darbo pavadinimas Gliukozės oksidazės inhibicijos tyrimai gliukozės biologiniais jutikliais	Baigiamojo darbo vadovas dr. Natalija German
Anotacija (lietuvių k.) Kalcio jonų (Ca2+) buvimas tam tikromis sąlygomis gali turėti įtakos gliukozės oksidazės (GOx) katalizuojamų reakcijų kinetikai, todėl, sudėtingose sistemose, Ca2+ gali paveikti fermento aktyvumą. Remiantis GOx inhibicija, galima sukurti Ca2+ biologinį jutiklį, nustatant šią analitę žmogaus seilėse, tai galėtų padėti žmonėms su Sjogreno sindromu. Šio magistro darbo tikslas yra atlikti GOx inhibicijos kalcio jonais tyrimus gliukozės biologiniuose jutikliuose. Pirmiausiai buvo nustatyta, kad mediatorius (N-metilfenazino metosulfato) yra būtinas elektrocheminei reakcijai įvykti ant grafito elektrodo paviršiaus. Be to, gliukozės biologiniai jutikliai modifikuoti aukso nanodalelėmis (AuND) arba elektrochemiškai susintetintomis dendritinėmis aukso nanostruktūromis (DAuNS), pagal jautrumą bei aptikimo ribą yra pranašesni už nemodifikuotus biologinius jutiklius. Atlikus GOx inhibicijos tyrimus kalcio jonų atžvilgiu, nustatyta, kad aukso nanodarinių buvimas ant grafito elektrodo paviršiaus sustiprina fermento inhibiciją. Be to, kai gliukozės koncentracija didėja nuo 2 iki 10 mM, fermento aktyvumas atitinkamai mažėja. Sukurtas Ca2+ biologinis jutiklis GE/DAuNS/GOx, esant 2 mM gliukozės, yra pranašesnis už GE/AuND/GOx arba GE/GOx. Sukurtas biologinis jutiklis pasižymi platesniu tiesiniu koncentracijos intervalu (iki 38,4 mM), didesniu nustatymo jautrumu (1,21 µA/(mM cm2)) ir santykinai mažiausia aptikimo riba (0,253 mM). Šis biologinis jutiklis yra atsparus pašaliniams junginiams (natrio, kalio ir magnio jonams, askorbo ir šlapimo rūgštims) bei tinka Ca2+ nustatymui praskiestose žmogaus seilėse su 102-103 % išgava. Raktiniai žodžiai: aukso nanodalelės, dendritinės aukso nanostruktūros, gliukozės oksidazės inhibicija, kalcio jonų biologinis jutiklis. Anotacija (užsienio k.) The presence of calcium ions (Ca2+) can influence the kinetics of glucose oxidase (GOx)-catalyzed reactions under specific conditions. In addition, under certain conditions, especially in complex systems, Ca2+ can affect enzyme activity. Based on GOx inhibition, it is possible to develop a Ca2+ biosensor that detects the analyte in human saliva, which could help people with Sjögren's syndrome. The aim of this master’s thesis is to study the inhibition of GOx by calcium ions in glucose biosensors. It was first determined that the presence of the mediator, N-methylphenazine methosulfate, is essential for the electrochemical reaction to take place on the surface of the graphite electrode. Furthermore, glucose biosensors modified with gold nanoparticles (AuNP) or electrochemicaly synthesized dendritic gold nanostructures (DAuNS) demonstrated superior performance compared to unmodified biosensors. Studies of glucose oxidase inhibition by Ca²? revealed that the presence of gold nanocompounds on graphite electrode surface enhances enzyme inhibition. This effect becomes more pronounced as the glucose concentration increases from 2 to 10 mM. The developed Ca2+ biosensor based on GE/DAuNS/GOx in the presence of 2 mM glucose outperforms due to its wide linear concentration range (up to 38.4 mM), high detection sensitivity (1.21 µA/(mM cm2)) and low limit of detection (0.253 mM) than those based on GE/AuNP/GOx or GE/GOx. This biosensor is resistant to foreign interfering compounds (sodium, potassium and magnesium ions, ascorbic acid and uric acid) and is suitable for the determination of Ca2+ in dilute human saliva samples with a recovery of 102-103 %. Raktiniai žodžiai: gold nanoparticles, dendritic gold nanostructures, inhibition of glucose oxidase, calcium ion biosensor.
Studento vardas, pavardė Martynas Zalieckas	Baigiamojo darbo pavadinimas Anglimi grįstų kvantinių taškų ir priešvėžinių savybių turinčių junginių komplekso optinių savybių tyrimas	Baigiamojo darbo vadovas dr. Vitalijus Karabanovas
Anotacija (lietuvių k.) Chinonų grupės vaistai, tokie kaip doksorubicinas (DOX), plačiai taikomi chemoterapijoje. Tokių vaistų vartojimas gali sukelti stiprų nepageidaujamą poveikį, pavyzdžiui vėžio širdies nepakankamumą. Dėl to intensyviai vystomos kontroliuojamos vaistų pernašos sistemos, pagrįstos nanonešikliais, leidžiančios tikslingai išlaisvinti vaistus konkrečiuose biologiniuose taikiniuose. Tarp perspektyvių kandidatų tokioms sistemoms kurti vis daugiau dėmesio sulaukia sunkiųjų metalų neturintys, anglies pagrindu sukurti kvantiniai taškai, tokie kaip grafeno kvantiniai taškai (GQD), anglies kvantiniai taškai (CQD) bei anglies nitrido kvantiniai taškai (CNQD). Šie kvantiniai taškai pasižymi pažangiomis paviršiaus funkcionalizavimo galimybėmis ir stipriomis liuminescencinėmis savybėmis, leidžiančiomis valdyti nanonešiklio ir vaisto komplekso lokalizaciją ląstelėje. Šiame darbe tirtas anglies nitrido kvantinių taškų (CNQD) stabilumas bei jų optinės savybės ir sąveika su priešvėžinėmis medžiagomis taikant spektroskopinius metodus. CNQD buvo susintetinti hidrotermine sinteze naudojant urėją arba tiourėją ir citrinos rūgštį. Spektroskopinė analizė parodė efektyvią CNQD sąveiką su DOX, stipriausiai pasireiškiančią esant 1:1 masės santykiui. Taip pat nustatyta, kad CNQD/DOX kompleksai pasižymi pH jautrumu – ryškiausia ir stabiliausia sąveika stebėta prie fiziologinio pH (7,4). Šie rezultatai leidžia teigti, kad CNQD turi potencialą būti pritaikyti vaistų biomedicinos srityse, ypač vaistinių medžiagų transporte kur pH jautrumas yra itin svarbus. Baigiamojo magistro darbą sudaro šešios dalys: įvadas, literatūros analizė, metodų ir medžiagų aprašymas, rezultatų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas. Darbo apimtis – 57p. teksto be priedų, 25 iliustr., 1 lentelė 94 bibliografiniai šaltiniai Raktiniai žodžiai: anglies nitridas, anglies nitrido kvantiniai taškai, doksorubicinas, spektroskopija, fluorescencija, hidroterminė sintezė, Anotacija (užsienio k.) Quinone-based drugs such as doxorubicin (DOX), daunorubicin, etc., are widely used in cancer chemotherapy. Their use has adverse side effects such as dilated cardiomyopathy and heart failure. This has led to the development of controllable nanocarrier-based drug delivery systems that allow for the targeted release of drugs at specific locations. Potential candidates for the development of such systems, heavy metal-free carbon-based quantum dots, such as graphene quantum dots (GQD), carbon quantum dots (CQD), and carbon nitride quantum dots (CNQD), are receiving increasing attention. Carbon-based quantum dots, with advanced surface functionalization and luminescent properties that allow the control of the intracellular location of nanocarrier-drug complexes, are a promising nanostructured material for theranostics, as they can simultaneously provide imaging and therapeutic effects. In this study, we focus on investigating the stability and optical properties of carbon nitride quantum dots (CNQD) and compounds with anticancer properties using spectroscopic methods. (CNQDs) were synthesised using hydrothermal synthesis from urea/thiourea and citric acid. Spectroscopic analysis revealed an effective interaction with DOX, with the most stable mass ratio being 1:1 CNQD/DOX. Additionally, the CNQD/DOX system exhibits pH sensitivity. The most stable and pronounced interaction was observed at physiological pH (7.4). This suggests that CNQDs may offer enhanced performance in drug delivery or biomedical applications where pH-responsiveness is critical. The work consists of seven parts: introduction, literature analysis, description of methods and materials, discussion of results, conclusions, a list of references, and acknowledgements. Thesis consists of: 57 p. text without appendices, 25 illustrations, 1 table, 94 bibliographic sources. Raktiniai žodžiai: Carbon nitride, Carbon nitride quantum dots, doxorubicin, spectroscopy, Fluorescence, hydrothermal synthesis.
Studento vardas, pavardė Deimantė Stakelytė	Baigiamojo darbo pavadinimas Oligonukleotidais modifikuotų elektrodų sintezė ir tyrimas	Baigiamojo darbo vadovas doc. dr. Rūta Ivanec-Goranina
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame magistro darbe nagrinėjamas elektrocheminis biojutiklis, skirtas vieno nukleotido polimorfizmo nustatymui žmogaus genominėje DNR iškart po PGR, išvengiant termperatūros gradientų poreikio. Teorinėje dalyje aptariamas oligonukleotidų modifikavimas, elecktrocheminiai biojutikliai ir vieno nukelotido polimorfizmo nustatymui skirti biojutikliai bei tikslinis CYP2C19 genas. Analitinėje darbo dalyje atlikus ciklinės voltamperometrijos ir linijinio skleidimo voltamperometrijos matavimus ir duomenų analizę atliktas zondo sekos pasirinkimas. Optimizavus biojutiklio veikimo sąlygas atliktas elektrocheminis trijų galimų tikslinio polimorfizmo diplotipų atskyrimas ant to paties paviršiaus. Atlikti matavimai su genominės žmogaus seilių DNR mėginiais. Susintetinus ir ištyrus biojutiklį pateikiamos darbo išvados Baigiamąjį magistro darbą sudaro 7 dalys: įvadas, literatūros analizė, metodai ir medžiagos, rezultatai ir jų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas, padėka. Darbo apimtis – 54 p. teksto be priedų, 73 psl. su priedais, 17 iliustr., 6 lent., 72 bibliografiniai šaltiniai. Raktiniai žodžiai: Vieno nukleotido polimorfizmas; aukso paviršius; biojutiklis; lydymasis; CYP2C19 Anotacija (užsienio k.) This Master's thesis focuses on an electrochemical biosensor for the detection of single nucleotide polymorphisms in human genomic DNA immediately after PCR, avoiding the need for thermal gradients. The theoretical part of the study covers oligonucleotide modification, electrochemical biosensors, single nucleotide polymorphism detection biosensors, and the CYP2C19 target gene. In the analytical part of the work, probe sequence selection was performed by cyclic voltammetry and linear sweep voltammetry measurements and data analysis. After optimisation of the operating conditions of the biosensor, electrochemical detection of three possible diplotypes of the target polymorphism was performed on a single surface. Measurements were performed on amplified human saliva DNA samples. This thesis consists of 7 parts: introduction, literature review, methods and materials, results and discussion, conclusions, list of references and acknowledgment. Thesis consists of: 54 p. text without appendices, 73 p. with appendices, 17 pictures, 6 tables, 72 bibliographical entries. Raktiniai žodžiai: Single nucleotide polymorphism; Gold surface; Biosensor; Melting; CYP2C19
Studento vardas, pavardė Julita Greviškytė	Baigiamojo darbo pavadinimas Elektrocheminio nemediatorinio gliukozės biologinio jutiklio kūrimas, analitinių požymių įvertinimas bei tinkamumo praktiniam pritaikymui tyrimas	Baigiamojo darbo vadovas dr. Natalija German
Anotacija (lietuvių k.) Elektrocheminiai biologiniai jutikliai plačiai naudojami maisto pramonėje, medicinoje, diagnozuojant pacientams cukrinį diabetą. Jie yra nesudėtingos sandaros, pasižymi gebėjimu specifiškai ir greitai aptikti mažus analičių kiekius. Kuriamas biologinis jutiklis yra grafito elektrodas modifikuotas dendritinėmis aukso nanostruktūromis, cistamino dihidrochloridu, 13 nm aukso nanodalelėmis ir imobilizuotas gliukozės oksidaze (GE/DAuNS/CADHCl/AuND/GOx). Nemediatorinio biologinio jutiklio charakterizavimas ir analizinių savybių tyrimai yra atliekami, panaudojant ciklinę voltamperometriją ir chronoamperometriją. Nustatyta, kad biologinis jutiklis GE/DAuNS/CADHCl/AuND/GOx pagrindu pasižymi geromis analizinėmis charakteristikomis: tiesiniu intervalu nuo 0,050 iki 0,990 mM su patikimu korealiacijos koeficientu R2 = 0,9965, 0,027 mM aptikimo riba ir 88,9 µA/(mM cm2) jautrumu. Taip pat įvertintas jutiklio GE/DAuNS/CADHCl/AuND/GOx pagrindu stabilumas laike, atsparumas trukdantiems junginiams ir praktinis pritaikymas žmogaus serume. Sukurta sistema biologinį aktyvumą - 73,5 % išlaikė iki 71 paros, ir pasižymi geru atsparumu trukdantiems junginiams: angliavandeniams, askorbo ir šlapimo rūgštims. Nustatyta gliukozės koncentracija žmogaus serume sudarė 0,396 ± 0,042 mM su 94,5 % išgava. Baigiamojo magistro darbą sudaro dešimt dalių: santrumpų sąrašas, paveikslų sąrašas, lentelių sąrašas, įvadas, literatūros analizė, metodų ir medžiagų aprašymas, rezultatų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas ir padėka. Darbo apimtis – 64 p. teksto be priedų, 34 iliustr., 1 lent., 83 bibliografiniai šaltiniai. Raktiniai žodžiai: Aukso nanodalelės, aukso nanostruktūros, elektrocheminiai matavimai, gliukozės biologinis jutiklis, gliukozės oksidazė. Anotacija (užsienio k.) Electrochemical biosensors are widely used in the food industry, medicine, and for diagnosing diabetes in patients. They have a simple structure and are characterized by their ability to specifically and rapidly detect small amounts of analytes. The developed biosensor is a graphite electrode modified with dendritic gold nanostructures, cystamine dihydrochloride, 13 nm gold nanoparticles, and immobilized glucose oxidase (GE/DAuNS/CADHCl/AuNP/GOx). The characterization of the non-mediated biosensor and the investigation of its analytical properties are performed using cyclic voltammetry and chronoamperometry. It has been determined that the GE/DAuNS/CADHCl/AuNP/GOx biosensor exhibits excellent analytical characteristics, with a linear range from 0.050 to 0.990 mM, a reliable correlation coefficient R² = 0.9965, a limit of detection of 0.027 mM, and a sensitivity of 88.9 µA/(mM cm²). Additionally, the stability of the GE/DAuNS/CADHCl/AuNP/GOx-based sensor over time, the resistance to interfering compounds and practical application in human serum has been evaluated. The developed system retained 73.5 % of its biological activity for up to 71 days and exhibits good resistance to interfering compounds: carbohydrates, ascorbic and uric acids. Detected glucose concentration in human serum was 0.396 ± 0.042 mM with a recovery of 94.5 %. The work consists of seven parts: abbreviations, list of pictures, list of tables, introduction, literature analysis, description of methods and materials, discussion of results, conclusions, list of references and acknowledgment. Thesis consists of: 64 p. text without appendices, 34 illustrations, 1 table, 83 bibliographic sources. Raktiniai žodžiai: Gold nanoparticles, gold nanostructures, electrochemical measurements, glucose biosensor, glucose oxidase.
Studento vardas, pavardė Laurita Juočytė	Baigiamojo darbo pavadinimas (Bio)plastikų įtaka Lietuvos dirvožemio mikrooganizmų įvairovei	Baigiamojo darbo vadovas dr. Saloua Biyada
Anotacija (lietuvių k.) Baigiamajame magistro darbe nagrinėjamas mikro- ir nano(bio)plastikų, atsirandančių dėl bioplastikų ir tradicinių plastikų biodegradacijos proceso, dalelių kaupimasis dirvožemyje, jų degradacijos mechanizmai ir įtaka dirvožemio fizikinėms, cheminėms savybėms bei dirvožemio mikrobiotai. Darbe aptariama bioplastikų ir įprastinių plastikų klasifikacija pagal kilmę ir jų savybės, nagrinėjamos irimui dirvožemyje reikalingos sąlygos. Pateikiamas mikro- ir nano(bio)oplastikų identifikavimo dirvožemyje metodų aprašymas, įskaitant SEM mikroskopiją ir (bio)plastikų išskyrimą filtracijos metodu. Eksperimentinėje darbo dalyje bioplastikų ir tradicinių plastikų dalelių ekstrakcija iš šiltnamio ir kontrolinių dirvožemio mėginių buvo sėkmingai atlikta filtravimo būdu. Mikroskopinė analizė patvirtino mikro(bio)plastiko kaupimąsi dirvožemyje. Išnagrinėta mikrobinė įvairovė parodė esminius skirtumus tarp kontrolinio dirvožemio mėginių ir dirvožemio iš šiltnamių – nustatyta, kad (bio)plastiko kaupimasis dirvožemyje daro įtaką bakterijų ir grybų taksonominei įvairovei. Darbą sudaro šešios dalys: įvadas, literatūros apžvalga, medžiagos ir metodai, rezultatai ir jų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas. Darbo apimtis – 57 p. teksto be priedų, 18 iliustr., 8. lentl., 83 bibliografiniai šaltiniai. Raktiniai žodžiai: plastikas, mikro-plastikas, nano-plastikas, bioplastikas, bio-mikroplastikas, bio-nanoplastikas, dirvožemio užterštumas, mikrobų įvairovė, biologinis skaidymas. Anotacija (užsienio k.) The master's thesis examines the presence of micro- and nano-(bio)plastic particles in soil and their impact on the physical-chemical properties of the soil and microbial diversity. A description of the methods for identifying micro- and nano-(bio)plastics in soil is provided, including SEM microscopy and the separation of (bio)plastics by filtration. In the experimental part of the work, the extraction of bioplastic and conventional plastic particles from greenhouse and control soil samples was successfully performed by filtration. Microscopic analysis confirmed the presence of micro(bio)plastics in soil. The analyzed microbial diversity showed significant differences between the control soil samples and the soil from the greenhouses – it was found that the presence of (bio)plastic in the soil affects the taxonomic diversity of bacteria and fungi. The work consists of six parts: introduction, literature review, materials and methods, results and their discussion, conclusions, references. The work is 57 p. of text without appendices, 18 illustrations, 8 tables, 83 bibliographical entries. Raktiniai žodžiai: plastic, micro-plastic, nano-plastic, (bio)plastic, (bio)-microplastic, (bio)-nanoplastic, soil contamination, microbial diversity, biodegradation.
Studento vardas, pavardė Paulina Bartkutė	Baigiamojo darbo pavadinimas Probiotinėmis ir biokontrolės savybėmis pasižymintys mikroorganizmai medūnešėse bitėse	Baigiamojo darbo vadovas doc. dr. Elena Servienė
Anotacija (lietuvių k.) Medunešių bičių (Apis mellifera) gaminami produktai yra vertingi teršalų, tokių kaip ore esančios kietosios dalelės, sunkieji metalai ir pesticidai, biologiniai rodikliai. Bitės taip pat atlieka esminį vaidmenį palaikant ekosistemų biologinę įvairovę. Vis dėlto pastaraisiais metais pasaulyje stebimas didėjantis bičių mirtingumas, siejamas su įvairiomis infekcijomis. Siekdami sumažinti tam tikrų ligų plitimą avilyje, bitininkai dažnai pašalina tranus, tačiau jų biologinis potencialas iki šiol išlieka mažai ištirtas, todėl būtini tolesni moksliniai tyrimai. Šio darbo metu tirtos mikroorganizmų, esančių medunešių bičių tranų lervose, probiotinės ir biokontrolės savybės. Atlikus biocidinio aktyvumo analizę, nustatyta, kad 12 kamienų biocidiškai veikė toksinų poveikiui jautrų S. cerevisiae ?‘1 kamieną. Įvertinus tiriamų mikroorganizmų antibakterinius ir antagonistinius aktyvumus nustatyta, kad šiomis savybėmis stipriausiai pasižymėjo Metschnikowia pulcherrima ir Metschnikowia fructicola. Atlikus autoagregacijos bei hidrofobiškumo tyrimus, nustatyta, jog didžiausiomis probiotinėmis savybėmis pasižymėjo Starmerella apis, Metschnikowia reukaufii, Metschnikowia pulcherrima, Starmerella bombi, Starmerella geochares ir Starmerella magnoliae rūšys. Darbą sudaro šešios dalys: įvadas, literatūros apžvalga, medžiagos ir metodai, rezultatai ir jų aptarimas, išvados ir literatūros sąrašas. Darbo apimtis – 64 psl. be priedų, 10 iliustr., 15 lent., 64 bibliografiniai šaltiniai ir 1 priedas. Raktiniai žodžiai: Medunešės bitės, tranai, lervos, probiotinės savybės, biokontrolės savybės. Anotacija (užsienio k.) Products produced by honey bees (Apis mellifera) serve as valuable biological indicators of environmental pollutants such as heavy metals and pesticides. Bees also play a crucial role in maintaining ecosystem biodiversity. However, in recent years, increasing honey bee mortality has been observed worldwide, largely due to various infections. In an effort to reduce disease spread within hives, beekeepers often remove drone brood, yet the biological potential of drones remains poorly studied, highlighting the need for further research. This study investigated the probiotic and biocontrol properties of microorganisms isolated from drone larvae of honey bees. Biocidal activity analysis revealed that 12 strains exhibited biocidal effects against the toxin–sensitive Saccharomyces cerevisiae ?'1 strain. Antibacterial and antagonistic activity assessments indicated that Metschnikowia pulcherrima and Metschnikowia fructicola showed the highest efficacy. Autoaggregation and hydrophobicity tests further revealed that Starmerella apis, Metschnikowia reukaufii, Metschnikowia pulcherrima, Starmerella bombi, Starmerella geochares, and Starmerella magnoliae possess the greatest potential as probiotic microorganisms. The thesis consists of six sections: introduction, literature review, materials and methods, results and discussion, conclusions and references. Thesis consists of: 64 p. text without appendices, 10 pictures, 15 tables, 64 bibliographical entries and 1 appendix. Raktiniai žodžiai: Honey bees, honey bee drones, larvae, probiotic properties, biocontrol properties.

- Puslapio administratoriai:
- Emilija Blaškevič
- Ernestas Čepulionis
- Karolina Kardokaitė

Studijos

Anotacijos